http://dev.cmsmadesimple.org/project/files/711 ist dein Freund

und somit hat sich auch gleich die zweite Frage erledigt

EDIT 2: wie kann ich in der config.php am einfachsten/sichersten die Root-URL setzen, dass er die jeweilige Domain nimmt (Stichwort CGCalendar und yearlist  )

Schon damit probiert?

$config['root_url'] = $_SERVER['HTTP_HOST'];

Domain 1 -> Seite 1
Domain 2 -> Seite 2

Egal welche Domain es kommt immer die Standardstartseite (egal ob auf Seite 1 oder Seite 2), die eingestellt ist.

Ich hab im Menümanager alles verlinkt -> erkennt er auch richtig
er weiß welche Unterseiten zu welcher Domain gehören und setzt die "richtigen" Links

Ich hab für jede Domain ein eigenes Template - ganz am Anfang ist eingetragen: {cms_module module="MultiDomains"}

Wenn ich Unterseiten mit der verkehrten Domain aufrufe, dann stellt er die auch richtig, also aus:
Domain1/startseite2/unterseite wird Domain2/startseite2/unterseite und umgekehrt.

So wo hab ich jetzt das Brett vorm Kopf

ach ja: die zweite Domain nutzt symlink auf das Verzeichnis der ersten

EDIT: htaccess und config sehen so aus:

RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_URI} !/$
RewriteCond %{REQUEST_URI} !\.
RewriteCond %{REQUEST_METHOD} !POST$
RewriteRule ^(.*) %{REQUEST_URI}/ [NE,R=301,L]

RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f [NC]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d [NC]
RewriteRule ^(.+)$ index.php?page=$1 [QSA]

$config['url_rewriting'] = 'mod_rewrite';
$config['page_extension'] = '';
$config['query_var'] = 'page';

EDIT 2: wie kann ich in der config.php am einfachsten/sichersten die Root-URL setzen, dass er die jeweilige Domain nimmt (Stichwort CGCalendar und yearlist  )